为了增强序列比对结果的科学严谨，张素华等人还通过“系统发育树”分析法为鉴定提供支撑。
“‘系统发育树’是生物信息学中描述不同生物之间的相关关系的方法。通过构建系统发育树，可以实现对某一段基因序列的溯源。”张素华通过实验发现，样本的基因序列与大眼长尾鲨的基因属于同源，进一步验证了软件比对的结果。
通过比对，张素华和她的同事们最终确定，接受鉴定的135份样本中有97份样本属于大眼长尾鲨。经过换算后，司鉴院出具鉴定结果报告，认定海警扣押的总共4吨鱼翅中约有71.8%属于这一物种。目前，上海警方已经以涉嫌走私濒危物种罪为由进行立案侦查。
自从非人源DNA鉴定纳入法医物证鉴定范围起，张素华先后参与了中华鲟种属鉴定、赛鸽个体识别与亲缘关系鉴定、猪、牛亲子鉴定等司法鉴定案件，对这一全新的司法鉴定领域有了深刻了解。
来自动植物的鉴定材料和人体组织相比有很大的不同，这些差异往往会让鉴定工作更加难以进行。张素华回忆起她以前参加的一件木材类种属鉴定案，当时她要对一件木制家具椅子进行鉴定，已确认制造该椅子的木材来源。由于木材已经过深度加工，想要提取植物DNA相当困难，整个鉴定过程耗费了大量时间和精力。
此外，非人源DNA鉴定作为一种全新的鉴定项目，行业标准和权威数据的缺失也是鉴定工作的一大难点。张素华坦言，目前对于非人源DNA的比对很大程度要依靠国外公开数据库记载的信息，一旦遇上数据库中没有记载的物种，鉴定工作就变得无据可依，难以开展下去。
对此，司鉴院也积极采取应对措施。今年司鉴院完成了大麻类植物种属和个体身份鉴定的行业标准制定，目前正在颁布中，该标准明确了对大麻类植物身份识别的合适区域以及相应的检测、分析手段，率先为这一类植物的司法鉴定提供了鉴定参考。此外，司鉴院自建了包括致幻植物、毒蘑菇在内的DNA条形码数据库，为这些物种的基因序列比对提供依据。
“目前，我们还在着手建立法医学非人源DNA数据库，以填补国内非人源司法鉴定的数据空白。”张素华说，科学探索没有尽头，只有不断更新优化设施方法和建立健全数据信息库，才能为人类解开更多未解之谜。