1949年，新中国成立，国民党败逃台湾。海峡两岸的军队就此开始了长达60年的对峙。
如今的两岸同胞，已很难想象当初两军对垒的局面紧张到了什么程度。在新中国建立后的数年里，以“反攻大陆”为目标的国民党军队，不断袭扰大陆。其间，美国航母曾云集台湾周边海域，使台海上空战云密布，让外界甚至猜测“第三次世界大战就要爆发”！
此后，金门炮战爆发。两岸军队你来我往地炮击对方阵地，从1958年到1979年，台湾海峡一直处于交战状态。
从蒋经国晚年开始，两岸关系逐渐得到改善，两军对峙的局面有所缓和。然而，李登辉、陈水扁的“台独”言论和行径，很快引发新一轮的台海危机，两岸的军事关系再度紧张起来。直到马英九成为台湾地区领导人，形势才又一次得到缓和。
可以说，在过去60年的大多数时间内，台湾海峡笼罩在战争阴云下。
然而，两岸人民包括军队毕竟是血脉相连的同胞，有太多的民族利益需要去共同维护。于是，两军在隔海对峙的同时，也根据形势需要，在不同时期展开了一些小范围的互动——有些是心照不宣的默契，有些是不经协商的配合。
那么，60年来，两岸军队到底有哪些鲜为人知的配合？这些配合为什么会发生？未来，两岸关系将走向何方？这是所有炎黄子孙都需要了解和思考的问题。
我军打西沙，路经台湾海峡 台军发信号：“请通过”
自1949年国民党退守台湾，海峡两岸的军队几乎一直处于剑拔弩张的对峙之中。但在中华民族利益受到外敌威胁、神圣国土面临侵犯等特殊时刻，两岸军队却能默契配合，共御外敌。
大陆战舰“借道”
1974年1月19日，南越阮文绍政权(当时，越南分为北越和南越两个政权)为抢占我南海资源，悍然下令舰队入侵我西沙诸岛。
当时，解放军南海舰队仅有4艘猎潜舰和2艘扫雷艇，总吨位不到2000吨，实力不及南越海军的1/3。但我英勇的人民海军充分发挥快速机动和灵活善战的优势，以小击大，击沉敌舰1艘，击伤并驱离敌舰3艘，取得了西沙海战的巨大胜利。南越海军不甘心失败，随后派出8艘军舰和大批飞机，陈兵西沙附近，南海上空仍然战云密布。
5月的一天，驻扎在舟山群岛的解放军东海舰队接到中央军委命令：“西沙有可能再次发生海战，南海舰队已难以独立完成作战任务。抽调东海舰队3艘导弹护卫舰紧急南下，支援南海舰队。”为了尽快赶到南海，中央军委指示，3艘护卫舰改变过去绕道琉球群岛、入太平洋、过巴士海峡的航线，而是通过台湾海峡，直奔南海。
东海舰队立即召集导弹护卫舰“昆明”号、“成都”号、“衡阳”号的舰长及其他中高级指挥员紧急开会，研究南下事宜。会议认为，此次舰队南下，遇到的最大难题是如何过台湾海峡。大陆解放20多年来，海峡两岸一直处于敌对状态，航道离岸边最近的只有几公里，不少海域在台湾炮兵的有效射程之内。平时，就是大陆的渔船通过，也常常遭到台湾军队的炮击，有时人员伤亡惨重。但这次情况紧急，3艘舰艇的指战员纷纷表示，就是有再大的困难、再大的危险，也要坚决完成增援西沙的任务。
5月16日，东海舰队3艘导弹护卫舰在夜幕的掩护下悄悄起航。
第二天凌晨，头舰观察哨报告：“前方已经到达台湾海峡的东引岛。”大家都知道，东引岛是台军设在海峡的要塞。该岛是马祖列岛中的一个小岛，位于福建闽江口外海，原分为东、西两个小岛，后由海堤连通，成为一个岛。上世纪50年代到70年代，台军所谓的“反共救国军指挥部”一直设在该岛。这里常年驻有上千的台军兵力，并配备了大批大口径舰炮、榴弹炮、反坦克炮以及速射炮等重武器。而台军接受美国导弹援助后，也通常是第一时间将反舰、防空导弹部署于此。因此，这里对大陆和经过此地的船只威胁甚大。
接到观察哨报告后，舰队指挥员下达了准备战斗的命令。
同时，“昆明号” 护卫舰打开信号灯，向东引岛台方守军发出了要求紧急通过台湾海峡的信号。
其实，东引岛上的台军早已通过雷达发现这支舰队，也做好了“战斗准备”。但台军指挥官看到信号后便不知所措。一支中共海军舰队居然大张旗鼓地要求通过台湾海峡，这可是20多年来从没遇到过的事情。怎么办？他们立即给台湾“海军司令部”发了紧急电报。
接到电报，台湾“国防部长” 高魁元和“海军总司令”宋长志急忙赶到位于台北士林的蒋介石官邸。时年88岁的蒋介石因之前做过一次手术，身体比较虚弱，所以将一切军政事务都交给了蒋经国处理。不过，事关重大的一些决策问题，尤其是事关两岸的问题，各级官员还是要向他请示。
正在躺椅上闭目养神的蒋介石，听到了一阵脚步声，睁眼一看，远处走来一行人，被卫士给拦住了。他看清为首的是“国防部长”高魁元，便摆了摆手：“叫他们过来吧。”
“什么事情？还要你们跑到我这里来？”
“总统，是这样的，中共海军3艘导弹护卫舰，今天早晨到达我东引岛海面，企图通过台湾海峡。海军司令部发了一个急电，为慎重起见，我专程来请您谕示。”
“哦……”蒋介石应了一声，许久没有再说话。
此前，蒋介石也一直关注着西沙的战事。他曾让蒋经国指示台湾“外交部”发表公告，再次声明中国是南沙、西沙等群岛的唯一享有合法主权的国家，其主权不容置疑……
蒋介石扫了高魁元一眼，慢慢闭上了眼睛，像是自言自语地轻轻叹喟道：“西沙战事紧啊!”
高魁元立刻明白了蒋介石的意思，马上说道：“总统，允许中共军舰通过台湾海峡，此后可为惯例？”
蒋介石又意味深长地说：“那是路远啊!”
高魁元与宋长志交换了一下眼神，心领神会地退了下去。
当晚，夜色笼罩的东引岛，高高的信号台上，突然亮起了强光穿雾信号灯。信号灯一闪一闪地向解放军舰队发出“请通过……请通过……”的信号。
“昆明号”、“成都号”、“衡阳号”3舰接到信号，立即起锚，乘风破浪驶向南海。
此后，在南海的数次海战中，人民海军的南下舰队，都是途经台湾海峡支援南沙海战的。
太平岛补充给养
不仅如此，1988年初，解放军舰艇还在台军控制的太平岛停留一周，补充粮食饮水。
当时，解放军派出一个代号为“522”的海军舰艇编队，到南沙海域巡视。据舰队指战员回忆，1月23日，我海军编队在大风大浪中航行了三天三夜后，到达南沙海域。
分散在这里的小岛，有台湾军队占领的，也有越南军队侵占的。当我海军编队驶过北子岛海面时，一群越南士兵从岛上的工事里爬出来，蹲在沙滩上，向我军舰探头探脑。工事上架着两挺重机枪，并随时准备开枪。但不一会儿，他们又迅速躲到工事里去了。当我海军编队驶近南子岛时，又见一名越南士兵跑到沙滩上观望了一阵子。随后他又叫来一位长官模样的人，两人嘀咕了一阵子，便钻进工事里去了。
中午一点左右，我海军编队来到太平岛附近海面，准备抛锚待命。
太平岛是南沙群岛中最大的岛，面积0.443平方公里，岛上有茂密的树木，还建有码头、环岛防御工事和楼房。这里驻守着台湾军队400多名官兵。当时，太平岛码头有一艘台军登陆舰正在卸物资，港外有一艘162号驱逐舰和一艘443号高速炮艇正在执行警戒任务。
“舰长，驻守在太平岛上的台湾官兵也很辛苦，我们可不可以向他们表示问候？”我海军编队中“宜宾”舰上的官兵们首先提议。
得到应允后，我海军“552”编队几艘舰艇同时拉响了汽笛。太平岛上的台军官兵平时经常遭到越南军队的袭扰，不胜其烦。这时看到大陆军队的到来，也备感亲切。他们马上予以回应，并同意我海军“552”编队所有舰艇在太平岛停留一个星期。
其间，我海军编队还从太平岛得到了淡水和主副食品的补给。
此消息很快传到了台湾岛内，驻守太平岛的台军不但没有受到“惩戒”，时任台湾“国防部长”的郑为元还公开表示，“如果再发生战争，国军将助中共军队抗战”。此后，台湾方面在1993年制定“南海政策纲领”时，明确提出要坚定维护南海主权，其“国防部”有关官员也屡次在公开场合表示，“不排除与大陆合作开发与管理南沙”。
钓鱼岛海域“待命”
两岸军队的默契配合，还体现在保卫钓鱼岛的行动中。
2008年，台湾《东森新闻报》曾报道，台湾“海巡署”护卫保钓船的舰艇，在钓鱼岛外海与日本海上保安厅的船舰对峙，台日双方相互较劲儿，气氛紧张。但在同一时间，解放军东海舰队也派出军舰在钓鱼岛外海警戒。文章说，6月10日，台湾“联合”号渔船被日舰撞沉后，解放军东海舰队就一直派军舰在附近海域加强巡逻。6月16日，当台湾“海巡署”的巡逻艇与日本海上保安厅的船只在钓鱼岛外海对峙时，解放军东海舰队悄悄派出两艘现代级驱逐舰及一艘护卫舰，“在钓鱼岛外海待命，准备一旦台日双方擦枪走火，立即驰援”。“台湾‘海巡署’巡逻艇上的人似乎胆子更壮了，丝毫也不退让”。事后，台湾分析人士认为，一旦台湾与日本在钓鱼岛海域“擦枪走火”，台海两岸军力存在“联合抗敌”的可能性。